Починалият Йохан Кройф беше известен като човек, който много държеше на семейните ценности. Той остави съпруга и три деца. Бившият играч на Барселона се жени за Дани Костър в края на 1968 година и всички твърдяха, че е бил щастлив с нея в последвалите близо 50 години. Двамата имат три деца - Шантал (р. 1970 г.), Сусила (1972 г.) и Жорди (1974 г.). Последното от тях - момчето Жорди Кройф, е най-известният наследник на Йохан, тъй като стана професионален футболист и дори игра за клубове като Барселона и Манчестър Юнайтед.
Точно с него е свързан и един от любопитните моменти в живота на Кройф-старши, който накара всички в Каталуня да го заобичат още повече. Йохан кръщава сина си на патрона на Каталуня Сан Жорди, който е символ на борбата на областта за независимост. По този начин той влиза в конфликт с управлението на диктатора генерал Франсиско Франко, тъй като в Испания по това време е било забранено деца да се кръщават "Жорди". Ето защо футболистът е принуден в дните след раждането да заведе сина си в Холандия, за да регистрира името му.
В кариерата си после Кройф-младши държеше да му викат само Жорди, защото не искаше постоянно да го сравняват с баща му.